La MIAB a été créée par l’Union Africaine le 3 février 2003 [Central Organ/MEC/AHG/Comm. (VII)]. Elle s’est terminée le 1er juin 2004 avec le déploiement de l’ONUB. La MIAB a été déployée, en attendant la décision du Conseil de Sécurité de créer l’ONUB, afin de superviser la mise en oeuvre des Accords de cessez-le-feu des 7 octobre et 2 décembre 2002. Elle a été précédée par une mission africaine d’observateurs militaires.

La MIAB avait pour objectifs de « fournir un appui aux initiatives relatives au désarmement et à la démobilisation ainsi que des conseils pour la réintégration des combattants ; [de] mettre tout en œuvre pour créer les conditions favorables à l’établissement d’une Mission de maintien de la paix des Nations unies ; [et de] contribuer à la stabilité politique et économique au Burundi.

Elle avait pour mandat d’"établir et maintenir la liaison entre les parties ; [de] contrôler et vérifier la mise en oeuvre des Accords de cessez-le-feu ; faciliter les activités de la Commission mixte de cessez-le-feu (JCC) et des Comités techniques pour la mise en place et la restructuration des forces nationales de défense et de police ; faciliter le déplacement des parties lors des mouvements planifiés pour la désignation des zones de rassemblement ; sécuriser les zones de rassemblement et de désengagement identifiées ; faciliter et fournir l’assistance technique pour le processus de désarmement, de démobilisation et de réintégration (DDR) ; faciliter la fourniture de l’assistance humanitaire y compris aux réfugiés et aux personnes déplacées ; coordonner les activités de la Mission avec la présentation des Nations unies au Burundi ; [et] assurer la protection des personnalités qui retournent au pays".

À la fin de l’année 2003, la MIAB comptait 2 645 hommes (866 fournis par l’Éthiopie, 228 par le Mozambique et 1 508 par l’Afrique du Sud) et 43 observateurs militaires (venus du Bénin, du Burkina Faso, du Gabon, du Mali et de la Tunisie).