À la demande du gouvernement comorien, la Mission de l’Union africaine pour le soutien aux élections aux Comores (MUASEC) a été approuvée par le Conseil de Paix et de Sécurité de l’Union africaine le 15 mars 2006. Dirigée par l’Afrique du Sud, composée de personnels militaires et policiers, la MUASEC avait pour mandat d’observer et de superviser le déroulement du processus électoral et de contribuer à créer un environnement stable avant, pendant et après la tenue des élections. La mission a pris fin le 9 juin 2006, deux semaines après l’investiture du nouveau président comorien, l’ayatollah Ahmed Abdallah M. Sambi.